Protein–RNA interactions for Protein: P37237

Fgf8, Fibroblast growth factor 8, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf8P37237 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf8P37237 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf8P37237 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf8P37237 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf8P37237 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf8P37237 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf8P37237 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf8P37237 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf8P37237 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf8P37237 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf8P37237 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf8P37237 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fgf8P37237 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fgf8P37237 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Fgf8P37237 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fgf8P37237 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fgf8P37237 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fgf8P37237 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgf8P37237 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.5 ms