Protein–RNA interactions for Protein: P36536

Sar1a, GTP-binding protein SAR1a, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1aP36536 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sar1aP36536 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sar1aP36536 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sar1aP36536 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sar1aP36536 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sar1aP36536 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sar1aP36536 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sar1aP36536 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sar1aP36536 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sar1aP36536 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sar1aP36536 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sar1aP36536 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sar1aP36536 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sar1aP36536 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sar1aP36536 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sar1aP36536 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sar1aP36536 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sar1aP36536 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sar1aP36536 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sar1aP36536 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sar1aP36536 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms