Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PtprkP35822 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PtprkP35822 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PtprkP35822 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PtprkP35822 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PtprkP35822 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PtprkP35822 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PtprkP35822 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PtprkP35822 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PtprkP35822 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PtprkP35822 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PtprkP35822 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PtprkP35822 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
PtprkP35822 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PtprkP35822 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PtprkP35822 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PtprkP35822 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PtprkP35822 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
PtprkP35822 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PtprkP35822 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PtprkP35822 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PtprkP35822 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PtprkP35822 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PtprkP35822 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PtprkP35822 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PtprkP35822 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PtprkP35822 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PtprkP35822 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PtprkP35822 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PtprkP35822 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PtprkP35822 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PtprkP35822 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PtprkP35822 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
PtprkP35822 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PtprkP35822 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
PtprkP35822 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PtprkP35822 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PtprkP35822 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PtprkP35822 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PtprkP35822 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PtprkP35822 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PtprkP35822 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PtprkP35822 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PtprkP35822 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PtprkP35822 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PtprkP35822 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PtprkP35822 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PtprkP35822 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PtprkP35822 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PtprkP35822 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PtprkP35822 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PtprkP35822 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PtprkP35822 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PtprkP35822 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PtprkP35822 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PtprkP35822 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PtprkP35822 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PtprkP35822 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PtprkP35822 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
PtprkP35822 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PtprkP35822 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PtprkP35822 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PtprkP35822 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PtprkP35822 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
PtprkP35822 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PtprkP35822 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PtprkP35822 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PtprkP35822 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PtprkP35822 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PtprkP35822 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PtprkP35822 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PtprkP35822 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
PtprkP35822 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PtprkP35822 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PtprkP35822 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PtprkP35822 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PtprkP35822 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PtprkP35822 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PtprkP35822 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PtprkP35822 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PtprkP35822 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PtprkP35822 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PtprkP35822 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PtprkP35822 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PtprkP35822 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
PtprkP35822 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PtprkP35822 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PtprkP35822 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PtprkP35822 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PtprkP35822 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
PtprkP35822 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PtprkP35822 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PtprkP35822 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PtprkP35822 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PtprkP35822 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PtprkP35822 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PtprkP35822 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
PtprkP35822 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PtprkP35822 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PtprkP35822 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms