Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddit3P35639 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddit3P35639 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddit3P35639 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddit3P35639 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddit3P35639 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddit3P35639 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddit3P35639 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddit3P35639 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddit3P35639 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddit3P35639 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddit3P35639 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddit3P35639 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddit3P35639 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddit3P35639 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddit3P35639 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ddit3P35639 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ddit3P35639 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ddit3P35639 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ddit3P35639 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ddit3P35639 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ddit3P35639 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ddit3P35639 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ddit3P35639 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ddit3P35639 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ddit3P35639 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ddit3P35639 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ddit3P35639 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ddit3P35639 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddit3P35639 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddit3P35639 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddit3P35639 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddit3P35639 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddit3P35639 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddit3P35639 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddit3P35639 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ddit3P35639 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ddit3P35639 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ddit3P35639 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ddit3P35639 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ddit3P35639 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ddit3P35639 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ddit3P35639 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddit3P35639 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddit3P35639 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddit3P35639 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddit3P35639 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddit3P35639 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddit3P35639 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddit3P35639 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddit3P35639 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddit3P35639 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddit3P35639 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddit3P35639 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddit3P35639 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddit3P35639 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddit3P35639 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddit3P35639 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddit3P35639 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddit3P35639 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddit3P35639 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddit3P35639 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddit3P35639 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddit3P35639 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddit3P35639 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddit3P35639 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddit3P35639 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddit3P35639 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddit3P35639 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddit3P35639 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddit3P35639 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddit3P35639 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddit3P35639 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddit3P35639 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddit3P35639 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ddit3P35639 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ddit3P35639 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ddit3P35639 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddit3P35639 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms