Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Rfc1P35601 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rfc1P35601 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rfc1P35601 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rfc1P35601 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rfc1P35601 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rfc1P35601 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rfc1P35601 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rfc1P35601 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rfc1P35601 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rfc1P35601 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Rfc1P35601 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rfc1P35601 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rfc1P35601 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rfc1P35601 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rfc1P35601 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rfc1P35601 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rfc1P35601 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rfc1P35601 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rfc1P35601 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rfc1P35601 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Rfc1P35601 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rfc1P35601 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rfc1P35601 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rfc1P35601 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rfc1P35601 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rfc1P35601 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rfc1P35601 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rfc1P35601 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rfc1P35601 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rfc1P35601 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rfc1P35601 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rfc1P35601 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rfc1P35601 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rfc1P35601 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rfc1P35601 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rfc1P35601 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rfc1P35601 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Rfc1P35601 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rfc1P35601 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rfc1P35601 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rfc1P35601 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rfc1P35601 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rfc1P35601 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rfc1P35601 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rfc1P35601 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rfc1P35601 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rfc1P35601 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rfc1P35601 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rfc1P35601 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rfc1P35601 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rfc1P35601 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rfc1P35601 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rfc1P35601 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rfc1P35601 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rfc1P35601 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rfc1P35601 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rfc1P35601 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rfc1P35601 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rfc1P35601 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rfc1P35601 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rfc1P35601 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rfc1P35601 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rfc1P35601 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rfc1P35601 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rfc1P35601 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rfc1P35601 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rfc1P35601 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rfc1P35601 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rfc1P35601 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rfc1P35601 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rfc1P35601 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rfc1P35601 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rfc1P35601 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rfc1P35601 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rfc1P35601 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rfc1P35601 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rfc1P35601 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rfc1P35601 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rfc1P35601 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Rfc1P35601 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rfc1P35601 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rfc1P35601 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Rfc1P35601 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rfc1P35601 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rfc1P35601 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rfc1P35601 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rfc1P35601 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rfc1P35601 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rfc1P35601 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rfc1P35601 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rfc1P35601 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rfc1P35601 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rfc1P35601 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rfc1P35601 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rfc1P35601 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rfc1P35601 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rfc1P35601 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rfc1P35601 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rfc1P35601 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms