Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Ly6dP35459 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ly6dP35459 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ly6dP35459 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ly6dP35459 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ly6dP35459 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ly6dP35459 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ly6dP35459 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ly6dP35459 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ly6dP35459 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ly6dP35459 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ly6dP35459 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ly6dP35459 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ly6dP35459 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ly6dP35459 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ly6dP35459 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ly6dP35459 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ly6dP35459 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ly6dP35459 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ly6dP35459 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ly6dP35459 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ly6dP35459 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ly6dP35459 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ly6dP35459 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ly6dP35459 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ly6dP35459 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ly6dP35459 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ly6dP35459 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ly6dP35459 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ly6dP35459 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ly6dP35459 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ly6dP35459 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ly6dP35459 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ly6dP35459 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ly6dP35459 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ly6dP35459 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ly6dP35459 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ly6dP35459 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ly6dP35459 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ly6dP35459 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ly6dP35459 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ly6dP35459 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ly6dP35459 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ly6dP35459 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ly6dP35459 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ly6dP35459 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ly6dP35459 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ly6dP35459 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ly6dP35459 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ly6dP35459 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ly6dP35459 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ly6dP35459 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ly6dP35459 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ly6dP35459 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ly6dP35459 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ly6dP35459 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ly6dP35459 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ly6dP35459 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ly6dP35459 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ly6dP35459 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ly6dP35459 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ly6dP35459 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ly6dP35459 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ly6dP35459 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ly6dP35459 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ly6dP35459 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ly6dP35459 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms