Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sftpa1P35242 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms