Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc5P32043 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms