Protein–RNA interactions for Protein: P31311

Hoxa11, Homeobox protein Hox-A11, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa11P31311 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxa11P31311 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxa11P31311 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxa11P31311 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxa11P31311 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxa11P31311 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxa11P31311 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxa11P31311 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Hoxa11P31311 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxa11P31311 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxa11P31311 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms