Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctnnd1P30999 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctnnd1P30999 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.9 ms