Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
VtnP29788 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VtnP29788 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VtnP29788 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VtnP29788 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
VtnP29788 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VtnP29788 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VtnP29788 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VtnP29788 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VtnP29788 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
VtnP29788 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VtnP29788 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VtnP29788 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VtnP29788 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VtnP29788 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VtnP29788 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VtnP29788 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VtnP29788 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VtnP29788 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VtnP29788 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VtnP29788 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VtnP29788 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VtnP29788 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VtnP29788 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VtnP29788 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VtnP29788 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VtnP29788 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VtnP29788 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VtnP29788 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VtnP29788 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VtnP29788 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VtnP29788 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VtnP29788 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VtnP29788 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VtnP29788 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VtnP29788 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VtnP29788 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VtnP29788 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VtnP29788 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VtnP29788 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VtnP29788 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VtnP29788 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VtnP29788 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VtnP29788 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VtnP29788 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VtnP29788 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VtnP29788 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VtnP29788 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VtnP29788 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VtnP29788 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
VtnP29788 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VtnP29788 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VtnP29788 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VtnP29788 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VtnP29788 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VtnP29788 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VtnP29788 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VtnP29788 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
VtnP29788 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VtnP29788 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VtnP29788 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VtnP29788 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VtnP29788 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
VtnP29788 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VtnP29788 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VtnP29788 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VtnP29788 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VtnP29788 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VtnP29788 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
VtnP29788 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VtnP29788 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VtnP29788 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VtnP29788 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
VtnP29788 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VtnP29788 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VtnP29788 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VtnP29788 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VtnP29788 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VtnP29788 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VtnP29788 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VtnP29788 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VtnP29788 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
VtnP29788 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VtnP29788 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VtnP29788 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VtnP29788 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VtnP29788 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VtnP29788 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VtnP29788 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VtnP29788 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VtnP29788 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VtnP29788 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
VtnP29788 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VtnP29788 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VtnP29788 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VtnP29788 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VtnP29788 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VtnP29788 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VtnP29788 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VtnP29788 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms