Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkcdP28867 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms