Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mmp3P28862 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mmp3P28862 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mmp3P28862 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Mmp3P28862 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mmp3P28862 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mmp3P28862 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mmp3P28862 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mmp3P28862 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mmp3P28862 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mmp3P28862 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mmp3P28862 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mmp3P28862 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mmp3P28862 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mmp3P28862 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mmp3P28862 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mmp3P28862 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mmp3P28862 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mmp3P28862 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mmp3P28862 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mmp3P28862 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mmp3P28862 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Mmp3P28862 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mmp3P28862 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mmp3P28862 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mmp3P28862 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mmp3P28862 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mmp3P28862 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Mmp3P28862 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mmp3P28862 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mmp3P28862 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Mmp3P28862 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mmp3P28862 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mmp3P28862 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mmp3P28862 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mmp3P28862 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mmp3P28862 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mmp3P28862 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mmp3P28862 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mmp3P28862 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mmp3P28862 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mmp3P28862 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Mmp3P28862 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mmp3P28862 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mmp3P28862 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mmp3P28862 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mmp3P28862 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mmp3P28862 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mmp3P28862 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mmp3P28862 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mmp3P28862 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mmp3P28862 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mmp3P28862 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mmp3P28862 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mmp3P28862 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mmp3P28862 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mmp3P28862 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mmp3P28862 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mmp3P28862 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mmp3P28862 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Mmp3P28862 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mmp3P28862 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mmp3P28862 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mmp3P28862 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mmp3P28862 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mmp3P28862 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mmp3P28862 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mmp3P28862 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mmp3P28862 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mmp3P28862 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mmp3P28862 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mmp3P28862 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mmp3P28862 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mmp3P28862 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mmp3P28862 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mmp3P28862 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mmp3P28862 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mmp3P28862 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mmp3P28862 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mmp3P28862 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Mmp3P28862 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mmp3P28862 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mmp3P28862 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mmp3P28862 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mmp3P28862 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mmp3P28862 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mmp3P28862 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mmp3P28862 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mmp3P28862 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mmp3P28862 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mmp3P28862 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mmp3P28862 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mmp3P28862 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mmp3P28862 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Mmp3P28862 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mmp3P28862 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mmp3P28862 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mmp3P28862 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mmp3P28862 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mmp3P28862 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms