Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PtprmP28828 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PtprmP28828 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PtprmP28828 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PtprmP28828 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PtprmP28828 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PtprmP28828 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PtprmP28828 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PtprmP28828 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PtprmP28828 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PtprmP28828 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PtprmP28828 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PtprmP28828 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PtprmP28828 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PtprmP28828 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PtprmP28828 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PtprmP28828 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PtprmP28828 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PtprmP28828 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PtprmP28828 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PtprmP28828 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PtprmP28828 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PtprmP28828 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PtprmP28828 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PtprmP28828 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PtprmP28828 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PtprmP28828 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PtprmP28828 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PtprmP28828 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PtprmP28828 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PtprmP28828 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PtprmP28828 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PtprmP28828 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PtprmP28828 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PtprmP28828 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PtprmP28828 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PtprmP28828 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PtprmP28828 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PtprmP28828 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PtprmP28828 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PtprmP28828 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PtprmP28828 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PtprmP28828 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PtprmP28828 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PtprmP28828 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PtprmP28828 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PtprmP28828 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PtprmP28828 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PtprmP28828 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PtprmP28828 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PtprmP28828 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PtprmP28828 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PtprmP28828 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PtprmP28828 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PtprmP28828 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PtprmP28828 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PtprmP28828 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PtprmP28828 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PtprmP28828 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PtprmP28828 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PtprmP28828 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PtprmP28828 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PtprmP28828 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PtprmP28828 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PtprmP28828 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PtprmP28828 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PtprmP28828 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PtprmP28828 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PtprmP28828 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
PtprmP28828 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PtprmP28828 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
PtprmP28828 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PtprmP28828 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PtprmP28828 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PtprmP28828 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PtprmP28828 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PtprmP28828 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PtprmP28828 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PtprmP28828 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PtprmP28828 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PtprmP28828 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PtprmP28828 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PtprmP28828 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PtprmP28828 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PtprmP28828 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PtprmP28828 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PtprmP28828 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PtprmP28828 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PtprmP28828 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PtprmP28828 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PtprmP28828 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PtprmP28828 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PtprmP28828 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PtprmP28828 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PtprmP28828 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PtprmP28828 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PtprmP28828 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PtprmP28828 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PtprmP28828 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PtprmP28828 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
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