Protein–RNA interactions for Protein: P28798

Grn, Granulins, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GrnP28798 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GrnP28798 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GrnP28798 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GrnP28798 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GrnP28798 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GrnP28798 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GrnP28798 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GrnP28798 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GrnP28798 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GrnP28798 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GrnP28798 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GrnP28798 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GrnP28798 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GrnP28798 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GrnP28798 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GrnP28798 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GrnP28798 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GrnP28798 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GrnP28798 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GrnP28798 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GrnP28798 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GrnP28798 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GrnP28798 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GrnP28798 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GrnP28798 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GrnP28798 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GrnP28798 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GrnP28798 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GrnP28798 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GrnP28798 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GrnP28798 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GrnP28798 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GrnP28798 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GrnP28798 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GrnP28798 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GrnP28798 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GrnP28798 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GrnP28798 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GrnP28798 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GrnP28798 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GrnP28798 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GrnP28798 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GrnP28798 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GrnP28798 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GrnP28798 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GrnP28798 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GrnP28798 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GrnP28798 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GrnP28798 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GrnP28798 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GrnP28798 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GrnP28798 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GrnP28798 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GrnP28798 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GrnP28798 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GrnP28798 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GrnP28798 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GrnP28798 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GrnP28798 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GrnP28798 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GrnP28798 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GrnP28798 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GrnP28798 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GrnP28798 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GrnP28798 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GrnP28798 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GrnP28798 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GrnP28798 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GrnP28798 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GrnP28798 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GrnP28798 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GrnP28798 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GrnP28798 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GrnP28798 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GrnP28798 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GrnP28798 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GrnP28798 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GrnP28798 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GrnP28798 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GrnP28798 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GrnP28798 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GrnP28798 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GrnP28798 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GrnP28798 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GrnP28798 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GrnP28798 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GrnP28798 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GrnP28798 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GrnP28798 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GrnP28798 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GrnP28798 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GrnP28798 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GrnP28798 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GrnP28798 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GrnP28798 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GrnP28798 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GrnP28798 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GrnP28798 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GrnP28798 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GrnP28798 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms