Protein–RNA interactions for Protein: P28571

Slc6a9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a9P28571 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms