Protein–RNA interactions for Protein: P28563

Dusp1, Dual specificity protein phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp1P28563 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dusp1P28563 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dusp1P28563 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms