Protein–RNA interactions for Protein: P28322

Etv4, ETS translocation variant 4, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv4P28322 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Etv4P28322 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Etv4P28322 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Etv4P28322 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Etv4P28322 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Etv4P28322 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Etv4P28322 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Etv4P28322 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Etv4P28322 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Etv4P28322 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Etv4P28322 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Etv4P28322 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Etv4P28322 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Etv4P28322 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms