Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LoxP28301 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LoxP28301 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LoxP28301 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LoxP28301 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LoxP28301 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LoxP28301 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LoxP28301 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LoxP28301 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LoxP28301 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LoxP28301 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LoxP28301 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LoxP28301 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LoxP28301 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LoxP28301 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LoxP28301 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LoxP28301 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LoxP28301 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LoxP28301 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LoxP28301 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LoxP28301 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LoxP28301 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LoxP28301 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LoxP28301 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LoxP28301 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LoxP28301 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LoxP28301 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LoxP28301 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LoxP28301 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LoxP28301 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LoxP28301 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LoxP28301 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LoxP28301 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LoxP28301 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LoxP28301 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LoxP28301 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LoxP28301 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LoxP28301 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LoxP28301 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LoxP28301 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LoxP28301 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LoxP28301 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LoxP28301 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LoxP28301 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LoxP28301 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LoxP28301 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LoxP28301 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LoxP28301 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LoxP28301 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LoxP28301 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LoxP28301 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LoxP28301 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LoxP28301 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LoxP28301 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LoxP28301 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LoxP28301 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LoxP28301 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LoxP28301 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LoxP28301 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LoxP28301 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LoxP28301 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LoxP28301 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LoxP28301 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LoxP28301 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LoxP28301 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LoxP28301 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LoxP28301 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LoxP28301 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LoxP28301 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LoxP28301 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LoxP28301 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LoxP28301 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LoxP28301 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LoxP28301 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LoxP28301 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LoxP28301 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LoxP28301 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LoxP28301 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LoxP28301 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LoxP28301 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LoxP28301 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LoxP28301 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LoxP28301 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LoxP28301 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LoxP28301 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LoxP28301 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LoxP28301 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LoxP28301 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LoxP28301 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LoxP28301 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LoxP28301 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LoxP28301 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LoxP28301 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LoxP28301 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LoxP28301 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LoxP28301 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LoxP28301 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LoxP28301 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LoxP28301 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LoxP28301 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms