Protein–RNA interactions for Protein: P28033

Cebpb, CCAAT/enhancer-binding protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpbP28033 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CebpbP28033 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CebpbP28033 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CebpbP28033 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CebpbP28033 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CebpbP28033 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CebpbP28033 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CebpbP28033 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CebpbP28033 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CebpbP28033 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CebpbP28033 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CebpbP28033 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CebpbP28033 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CebpbP28033 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CebpbP28033 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CebpbP28033 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CebpbP28033 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CebpbP28033 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CebpbP28033 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CebpbP28033 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CebpbP28033 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CebpbP28033 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CebpbP28033 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CebpbP28033 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CebpbP28033 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CebpbP28033 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CebpbP28033 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CebpbP28033 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CebpbP28033 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CebpbP28033 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CebpbP28033 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CebpbP28033 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CebpbP28033 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CebpbP28033 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CebpbP28033 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CebpbP28033 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CebpbP28033 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
CebpbP28033 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CebpbP28033 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
CebpbP28033 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CebpbP28033 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CebpbP28033 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CebpbP28033 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CebpbP28033 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CebpbP28033 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CebpbP28033 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CebpbP28033 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CebpbP28033 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CebpbP28033 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CebpbP28033 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CebpbP28033 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CebpbP28033 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CebpbP28033 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CebpbP28033 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CebpbP28033 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CebpbP28033 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CebpbP28033 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CebpbP28033 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CebpbP28033 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CebpbP28033 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CebpbP28033 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CebpbP28033 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CebpbP28033 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CebpbP28033 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CebpbP28033 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CebpbP28033 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CebpbP28033 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CebpbP28033 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CebpbP28033 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CebpbP28033 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CebpbP28033 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CebpbP28033 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CebpbP28033 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CebpbP28033 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CebpbP28033 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CebpbP28033 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CebpbP28033 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CebpbP28033 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CebpbP28033 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CebpbP28033 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CebpbP28033 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CebpbP28033 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CebpbP28033 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CebpbP28033 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CebpbP28033 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CebpbP28033 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CebpbP28033 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CebpbP28033 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CebpbP28033 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CebpbP28033 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CebpbP28033 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CebpbP28033 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CebpbP28033 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CebpbP28033 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CebpbP28033 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CebpbP28033 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CebpbP28033 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CebpbP28033 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CebpbP28033 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CebpbP28033 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms