Protein–RNA interactions for Protein: P27090

Tgfb2, Transforming growth factor beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb2P27090 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tgfb2P27090 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tgfb2P27090 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tgfb2P27090 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tgfb2P27090 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tgfb2P27090 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tgfb2P27090 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tgfb2P27090 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tgfb2P27090 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tgfb2P27090 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tgfb2P27090 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tgfb2P27090 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tgfb2P27090 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tgfb2P27090 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tgfb2P27090 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tgfb2P27090 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tgfb2P27090 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tgfb2P27090 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tgfb2P27090 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tgfb2P27090 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tgfb2P27090 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tgfb2P27090 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tgfb2P27090 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tgfb2P27090 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tgfb2P27090 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tgfb2P27090 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tgfb2P27090 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tgfb2P27090 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms