Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ChgaP26339 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ChgaP26339 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ChgaP26339 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ChgaP26339 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ChgaP26339 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ChgaP26339 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ChgaP26339 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ChgaP26339 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ChgaP26339 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ChgaP26339 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ChgaP26339 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ChgaP26339 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ChgaP26339 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ChgaP26339 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ChgaP26339 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ChgaP26339 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ChgaP26339 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ChgaP26339 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ChgaP26339 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ChgaP26339 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ChgaP26339 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ChgaP26339 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ChgaP26339 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ChgaP26339 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ChgaP26339 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ChgaP26339 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ChgaP26339 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ChgaP26339 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ChgaP26339 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ChgaP26339 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ChgaP26339 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ChgaP26339 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ChgaP26339 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ChgaP26339 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ChgaP26339 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ChgaP26339 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ChgaP26339 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ChgaP26339 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ChgaP26339 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ChgaP26339 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ChgaP26339 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ChgaP26339 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ChgaP26339 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ChgaP26339 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ChgaP26339 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ChgaP26339 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ChgaP26339 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ChgaP26339 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ChgaP26339 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ChgaP26339 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ChgaP26339 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ChgaP26339 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ChgaP26339 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ChgaP26339 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ChgaP26339 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ChgaP26339 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ChgaP26339 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ChgaP26339 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ChgaP26339 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms