Protein–RNA interactions for Protein: P25119

Tnfrsf1b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf1bP25119 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf1bP25119 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf1bP25119 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf1bP25119 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf1bP25119 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf1bP25119 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf1bP25119 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf1bP25119 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf1bP25119 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf1bP25119 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf1bP25119 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf1bP25119 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf1bP25119 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf1bP25119 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms