Protein–RNA interactions for Protein: P24699

Myf5, Myogenic factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myf5P24699 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Myf5P24699 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Myf5P24699 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Myf5P24699 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Myf5P24699 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Myf5P24699 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Myf5P24699 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Myf5P24699 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Myf5P24699 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Myf5P24699 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Myf5P24699 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Myf5P24699 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Myf5P24699 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Myf5P24699 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Myf5P24699 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Myf5P24699 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Myf5P24699 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Myf5P24699 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Myf5P24699 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Myf5P24699 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Myf5P24699 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Myf5P24699 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Myf5P24699 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Myf5P24699 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Myf5P24699 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Myf5P24699 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Myf5P24699 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Myf5P24699 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Myf5P24699 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Myf5P24699 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Myf5P24699 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Myf5P24699 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Myf5P24699 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Myf5P24699 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Myf5P24699 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Myf5P24699 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Myf5P24699 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Myf5P24699 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Myf5P24699 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Myf5P24699 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Myf5P24699 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Myf5P24699 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Myf5P24699 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Myf5P24699 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Myf5P24699 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Myf5P24699 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Myf5P24699 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Myf5P24699 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Myf5P24699 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Myf5P24699 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Myf5P24699 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Myf5P24699 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Myf5P24699 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Myf5P24699 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Myf5P24699 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Myf5P24699 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Myf5P24699 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Myf5P24699 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Myf5P24699 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Myf5P24699 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Myf5P24699 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Myf5P24699 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Myf5P24699 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Myf5P24699 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Myf5P24699 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myf5P24699 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myf5P24699 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myf5P24699 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myf5P24699 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myf5P24699 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myf5P24699 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myf5P24699 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myf5P24699 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Myf5P24699 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myf5P24699 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myf5P24699 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Myf5P24699 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myf5P24699 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myf5P24699 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myf5P24699 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myf5P24699 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myf5P24699 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Myf5P24699 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Myf5P24699 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Myf5P24699 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Myf5P24699 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Myf5P24699 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Myf5P24699 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Myf5P24699 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Myf5P24699 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Myf5P24699 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Myf5P24699 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Myf5P24699 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Myf5P24699 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Myf5P24699 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Myf5P24699 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Myf5P24699 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Myf5P24699 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Myf5P24699 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Myf5P24699 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms