Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
RarbP22605 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RarbP22605 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
RarbP22605 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RarbP22605 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RarbP22605 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RarbP22605 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RarbP22605 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RarbP22605 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RarbP22605 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RarbP22605 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RarbP22605 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
RarbP22605 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RarbP22605 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RarbP22605 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RarbP22605 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RarbP22605 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RarbP22605 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RarbP22605 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RarbP22605 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RarbP22605 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RarbP22605 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RarbP22605 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RarbP22605 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RarbP22605 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RarbP22605 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RarbP22605 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RarbP22605 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RarbP22605 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RarbP22605 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RarbP22605 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RarbP22605 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RarbP22605 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RarbP22605 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RarbP22605 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RarbP22605 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RarbP22605 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RarbP22605 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RarbP22605 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RarbP22605 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RarbP22605 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RarbP22605 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RarbP22605 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RarbP22605 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RarbP22605 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RarbP22605 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RarbP22605 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RarbP22605 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RarbP22605 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RarbP22605 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RarbP22605 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RarbP22605 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RarbP22605 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RarbP22605 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RarbP22605 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RarbP22605 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RarbP22605 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RarbP22605 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RarbP22605 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RarbP22605 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RarbP22605 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RarbP22605 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RarbP22605 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RarbP22605 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RarbP22605 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RarbP22605 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RarbP22605 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RarbP22605 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RarbP22605 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RarbP22605 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RarbP22605 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RarbP22605 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RarbP22605 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RarbP22605 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RarbP22605 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RarbP22605 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RarbP22605 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RarbP22605 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RarbP22605 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RarbP22605 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RarbP22605 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RarbP22605 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RarbP22605 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RarbP22605 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RarbP22605 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RarbP22605 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RarbP22605 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RarbP22605 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RarbP22605 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RarbP22605 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RarbP22605 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RarbP22605 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RarbP22605 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RarbP22605 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RarbP22605 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RarbP22605 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RarbP22605 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RarbP22605 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RarbP22605 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RarbP22605 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms