Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prim1P20664 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prim1P20664 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prim1P20664 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prim1P20664 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prim1P20664 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prim1P20664 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prim1P20664 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prim1P20664 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prim1P20664 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prim1P20664 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prim1P20664 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prim1P20664 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prim1P20664 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prim1P20664 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prim1P20664 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prim1P20664 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prim1P20664 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prim1P20664 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Prim1P20664 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prim1P20664 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prim1P20664 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prim1P20664 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Prim1P20664 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prim1P20664 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prim1P20664 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prim1P20664 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prim1P20664 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prim1P20664 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prim1P20664 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prim1P20664 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prim1P20664 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prim1P20664 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prim1P20664 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Prim1P20664 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prim1P20664 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prim1P20664 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prim1P20664 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prim1P20664 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prim1P20664 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prim1P20664 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Prim1P20664 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prim1P20664 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Prim1P20664 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prim1P20664 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prim1P20664 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prim1P20664 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prim1P20664 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prim1P20664 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prim1P20664 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prim1P20664 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prim1P20664 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Prim1P20664 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prim1P20664 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prim1P20664 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prim1P20664 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prim1P20664 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prim1P20664 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prim1P20664 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prim1P20664 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prim1P20664 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prim1P20664 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prim1P20664 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prim1P20664 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prim1P20664 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prim1P20664 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prim1P20664 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prim1P20664 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prim1P20664 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prim1P20664 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prim1P20664 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prim1P20664 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prim1P20664 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prim1P20664 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prim1P20664 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prim1P20664 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prim1P20664 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prim1P20664 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prim1P20664 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prim1P20664 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prim1P20664 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prim1P20664 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Prim1P20664 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prim1P20664 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prim1P20664 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prim1P20664 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prim1P20664 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prim1P20664 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prim1P20664 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prim1P20664 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prim1P20664 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prim1P20664 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prim1P20664 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prim1P20664 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prim1P20664 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prim1P20664 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prim1P20664 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prim1P20664 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prim1P20664 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prim1P20664 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms