Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms