Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TP20293 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TP20293 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TP20293 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TP20293 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TP20293 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TP20293 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TP20293 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TP20293 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TP20293 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TP20293 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TP20293 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TP20293 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TP20293 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TP20293 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TP20293 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TP20293 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TP20293 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TP20293 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TP20293 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TP20293 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TP20293 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TP20293 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TP20293 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TP20293 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TP20293 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TP20293 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TP20293 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TP20293 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TP20293 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TP20293 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TP20293 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TP20293 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TP20293 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TP20293 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TP20293 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TP20293 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TP20293 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TP20293 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TP20293 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TP20293 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TP20293 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TP20293 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TP20293 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TP20293 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TP20293 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TP20293 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TP20293 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TP20293 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TP20293 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TP20293 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TP20293 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TP20293 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TP20293 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TP20293 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TP20293 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TP20293 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TP20293 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TP20293 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TP20293 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TP20293 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TP20293 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TP20293 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TP20293 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TP20293 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TP20293 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TP20293 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TP20293 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TP20293 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TP20293 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TP20293 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TP20293 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TP20293 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TP20293 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TP20293 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TP20293 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TP20293 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TP20293 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TP20293 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TP20293 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TP20293 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TP20293 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TP20293 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TP20293 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TP20293 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TP20293 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TP20293 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TP20293 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TP20293 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TP20293 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TP20293 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TP20293 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TP20293 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TP20293 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TP20293 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TP20293 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TP20293 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TP20293 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TP20293 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TP20293 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms