Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
VimP20152 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VimP20152 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VimP20152 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VimP20152 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VimP20152 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VimP20152 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VimP20152 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VimP20152 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VimP20152 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VimP20152 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VimP20152 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VimP20152 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
VimP20152 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VimP20152 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VimP20152 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VimP20152 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VimP20152 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VimP20152 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VimP20152 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VimP20152 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VimP20152 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VimP20152 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VimP20152 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VimP20152 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VimP20152 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VimP20152 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VimP20152 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VimP20152 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VimP20152 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VimP20152 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VimP20152 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VimP20152 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VimP20152 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
VimP20152 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VimP20152 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VimP20152 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
VimP20152 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VimP20152 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VimP20152 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VimP20152 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
VimP20152 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VimP20152 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VimP20152 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VimP20152 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VimP20152 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VimP20152 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VimP20152 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
VimP20152 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VimP20152 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VimP20152 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
VimP20152 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VimP20152 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VimP20152 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VimP20152 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VimP20152 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VimP20152 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VimP20152 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VimP20152 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VimP20152 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VimP20152 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VimP20152 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VimP20152 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VimP20152 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VimP20152 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VimP20152 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VimP20152 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VimP20152 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VimP20152 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VimP20152 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VimP20152 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VimP20152 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
VimP20152 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
VimP20152 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
VimP20152 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
VimP20152 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
VimP20152 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
VimP20152 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VimP20152 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VimP20152 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VimP20152 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VimP20152 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VimP20152 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VimP20152 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VimP20152 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VimP20152 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VimP20152 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VimP20152 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VimP20152 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VimP20152 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VimP20152 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VimP20152 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VimP20152 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VimP20152 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VimP20152 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VimP20152 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VimP20152 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VimP20152 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VimP20152 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VimP20152 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms