Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PdgfaP20033 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms