Protein–RNA interactions for Protein: P18828

Sdc1, Syndecan-1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc1P18828 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdc1P18828 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdc1P18828 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdc1P18828 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdc1P18828 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdc1P18828 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdc1P18828 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdc1P18828 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdc1P18828 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdc1P18828 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdc1P18828 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdc1P18828 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdc1P18828 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdc1P18828 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdc1P18828 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdc1P18828 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdc1P18828 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdc1P18828 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdc1P18828 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdc1P18828 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdc1P18828 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdc1P18828 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdc1P18828 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdc1P18828 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdc1P18828 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdc1P18828 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdc1P18828 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdc1P18828 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdc1P18828 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdc1P18828 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdc1P18828 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdc1P18828 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdc1P18828 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdc1P18828 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdc1P18828 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdc1P18828 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdc1P18828 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdc1P18828 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdc1P18828 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdc1P18828 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdc1P18828 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdc1P18828 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdc1P18828 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdc1P18828 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdc1P18828 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdc1P18828 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdc1P18828 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdc1P18828 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdc1P18828 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdc1P18828 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdc1P18828 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdc1P18828 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdc1P18828 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdc1P18828 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdc1P18828 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdc1P18828 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdc1P18828 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdc1P18828 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdc1P18828 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdc1P18828 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdc1P18828 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sdc1P18828 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sdc1P18828 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sdc1P18828 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sdc1P18828 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sdc1P18828 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sdc1P18828 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sdc1P18828 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sdc1P18828 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdc1P18828 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms