Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P18526 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P18526 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P18526 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P18526 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
P18526 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P18526 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
P18526 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
P18526 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P18526 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P18526 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P18526 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18526 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P18526 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18526 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18526 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18526 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18526 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18526 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18526 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18526 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18526 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P18526 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18526 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18526 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18526 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18526 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P18526 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18526 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18526 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18526 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18526 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P18526 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18526 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18526 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18526 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18526 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18526 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18526 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P18526 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18526 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18526 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18526 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18526 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18526 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18526 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18526 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18526 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18526 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18526 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P18526 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18526 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18526 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18526 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P18526 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18526 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P18526 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18526 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18526 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18526 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18526 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18526 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18526 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P18526 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18526 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18526 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18526 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18526 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18526 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18526 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18526 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18526 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18526 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18526 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18526 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18526 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18526 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18526 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18526 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18526 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18526 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18526 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
P18526 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18526 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18526 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18526 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18526 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P18526 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
P18526 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18526 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18526 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18526 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18526 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18526 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18526 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
P18526 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18526 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18526 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18526 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18526 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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