Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxb1P17919 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Hoxb1P17919 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.9 ms