Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sptan1P16546 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms