Protein–RNA interactions for Protein: P13379

Cd5, T-cell surface glycoprotein CD5, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd5P13379 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd5P13379 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd5P13379 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd5P13379 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd5P13379 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd5P13379 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd5P13379 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd5P13379 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd5P13379 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd5P13379 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd5P13379 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd5P13379 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd5P13379 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd5P13379 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd5P13379 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd5P13379 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd5P13379 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd5P13379 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd5P13379 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd5P13379 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd5P13379 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms