Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nr4a1P12813 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms