Protein–RNA interactions for Protein: P11088

Flg, Filaggrin (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FlgP11088 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FlgP11088 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FlgP11088 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FlgP11088 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FlgP11088 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FlgP11088 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FlgP11088 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
FlgP11088 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FlgP11088 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FlgP11088 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FlgP11088 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FlgP11088 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FlgP11088 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FlgP11088 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FlgP11088 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FlgP11088 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FlgP11088 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FlgP11088 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FlgP11088 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FlgP11088 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FlgP11088 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
FlgP11088 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FlgP11088 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FlgP11088 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FlgP11088 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FlgP11088 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FlgP11088 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
FlgP11088 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FlgP11088 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FlgP11088 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FlgP11088 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FlgP11088 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FlgP11088 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FlgP11088 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
FlgP11088 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FlgP11088 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FlgP11088 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
FlgP11088 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
FlgP11088 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FlgP11088 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FlgP11088 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FlgP11088 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FlgP11088 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FlgP11088 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FlgP11088 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FlgP11088 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
FlgP11088 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FlgP11088 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FlgP11088 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FlgP11088 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FlgP11088 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FlgP11088 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FlgP11088 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
FlgP11088 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
FlgP11088 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FlgP11088 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FlgP11088 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FlgP11088 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FlgP11088 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
FlgP11088 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FlgP11088 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FlgP11088 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FlgP11088 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FlgP11088 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FlgP11088 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FlgP11088 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FlgP11088 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FlgP11088 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FlgP11088 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
FlgP11088 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FlgP11088 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FlgP11088 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FlgP11088 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FlgP11088 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FlgP11088 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FlgP11088 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FlgP11088 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FlgP11088 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FlgP11088 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FlgP11088 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FlgP11088 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
FlgP11088 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FlgP11088 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FlgP11088 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FlgP11088 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FlgP11088 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FlgP11088 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FlgP11088 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FlgP11088 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
FlgP11088 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
FlgP11088 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
FlgP11088 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FlgP11088 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FlgP11088 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FlgP11088 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FlgP11088 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FlgP11088 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FlgP11088 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FlgP11088 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FlgP11088 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms