Protein–RNA interactions for Protein: P10855

Ccl3, C-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl3P10855 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccl3P10855 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms