Protein–RNA interactions for Protein: P10300

Cd8b, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd8bP10300 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd8bP10300 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd8bP10300 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd8bP10300 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd8bP10300 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd8bP10300 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd8bP10300 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd8bP10300 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd8bP10300 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd8bP10300 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd8bP10300 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd8bP10300 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd8bP10300 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd8bP10300 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd8bP10300 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd8bP10300 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd8bP10300 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd8bP10300 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd8bP10300 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd8bP10300 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd8bP10300 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd8bP10300 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd8bP10300 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd8bP10300 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd8bP10300 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd8bP10300 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd8bP10300 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd8bP10300 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd8bP10300 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd8bP10300 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd8bP10300 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd8bP10300 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cd8bP10300 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd8bP10300 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd8bP10300 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd8bP10300 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd8bP10300 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd8bP10300 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd8bP10300 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd8bP10300 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cd8bP10300 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd8bP10300 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd8bP10300 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd8bP10300 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd8bP10300 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd8bP10300 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd8bP10300 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd8bP10300 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd8bP10300 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd8bP10300 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd8bP10300 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd8bP10300 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd8bP10300 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd8bP10300 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd8bP10300 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd8bP10300 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd8bP10300 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd8bP10300 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd8bP10300 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd8bP10300 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd8bP10300 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd8bP10300 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd8bP10300 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd8bP10300 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd8bP10300 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd8bP10300 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd8bP10300 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd8bP10300 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd8bP10300 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms