Protein–RNA interactions for Protein: P0C6B7

Igsf6, Immunoglobulin superfamily member 6, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf6P0C6B7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Igsf6P0C6B7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Igsf6P0C6B7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms