Protein–RNA interactions for Protein: P09920

Csf3, Granulocyte colony-stimulating factor, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3P09920 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csf3P09920 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csf3P09920 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csf3P09920 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csf3P09920 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csf3P09920 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Csf3P09920 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms