Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ifna9P09235 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna9P09235 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms