Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itgb1P09055 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itgb1P09055 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itgb1P09055 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itgb1P09055 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itgb1P09055 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb1P09055 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb1P09055 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb1P09055 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb1P09055 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb1P09055 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb1P09055 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb1P09055 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb1P09055 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb1P09055 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb1P09055 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb1P09055 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb1P09055 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb1P09055 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb1P09055 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb1P09055 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb1P09055 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb1P09055 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb1P09055 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb1P09055 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb1P09055 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb1P09055 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Itgb1P09055 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Itgb1P09055 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Itgb1P09055 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Itgb1P09055 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Itgb1P09055 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Itgb1P09055 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Itgb1P09055 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Itgb1P09055 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Itgb1P09055 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Itgb1P09055 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Itgb1P09055 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Itgb1P09055 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Itgb1P09055 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Itgb1P09055 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Itgb1P09055 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Itgb1P09055 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Itgb1P09055 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Itgb1P09055 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Itgb1P09055 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Itgb1P09055 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Itgb1P09055 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Itgb1P09055 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Itgb1P09055 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Itgb1P09055 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Itgb1P09055 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Itgb1P09055 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Itgb1P09055 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Itgb1P09055 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Itgb1P09055 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Itgb1P09055 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Itgb1P09055 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Itgb1P09055 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Itgb1P09055 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Itgb1P09055 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Itgb1P09055 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Itgb1P09055 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Itgb1P09055 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Itgb1P09055 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Itgb1P09055 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Itgb1P09055 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Itgb1P09055 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Itgb1P09055 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Itgb1P09055 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Itgb1P09055 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Itgb1P09055 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Itgb1P09055 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Itgb1P09055 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Itgb1P09055 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Itgb1P09055 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Itgb1P09055 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Itgb1P09055 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Itgb1P09055 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Itgb1P09055 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Itgb1P09055 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Itgb1P09055 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Itgb1P09055 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Itgb1P09055 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Itgb1P09055 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Itgb1P09055 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Itgb1P09055 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Itgb1P09055 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Itgb1P09055 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Itgb1P09055 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Itgb1P09055 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Itgb1P09055 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Itgb1P09055 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Itgb1P09055 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Itgb1P09055 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Itgb1P09055 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Itgb1P09055 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Itgb1P09055 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Itgb1P09055 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Itgb1P09055 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms