Protein–RNA interactions for Protein: P08551

Nefl, Neurofilament light polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeflP08551 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NeflP08551 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NeflP08551 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NeflP08551 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NeflP08551 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NeflP08551 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NeflP08551 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NeflP08551 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NeflP08551 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NeflP08551 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NeflP08551 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NeflP08551 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NeflP08551 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NeflP08551 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NeflP08551 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NeflP08551 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NeflP08551 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NeflP08551 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NeflP08551 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NeflP08551 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NeflP08551 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NeflP08551 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NeflP08551 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NeflP08551 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NeflP08551 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NeflP08551 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NeflP08551 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NeflP08551 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NeflP08551 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NeflP08551 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NeflP08551 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NeflP08551 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NeflP08551 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NeflP08551 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NeflP08551 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NeflP08551 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NeflP08551 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NeflP08551 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NeflP08551 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NeflP08551 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NeflP08551 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NeflP08551 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NeflP08551 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NeflP08551 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NeflP08551 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NeflP08551 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NeflP08551 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NeflP08551 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NeflP08551 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NeflP08551 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NeflP08551 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NeflP08551 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NeflP08551 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NeflP08551 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NeflP08551 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NeflP08551 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NeflP08551 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NeflP08551 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NeflP08551 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NeflP08551 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NeflP08551 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NeflP08551 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NeflP08551 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NeflP08551 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NeflP08551 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NeflP08551 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NeflP08551 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NeflP08551 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NeflP08551 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NeflP08551 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NeflP08551 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NeflP08551 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NeflP08551 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NeflP08551 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NeflP08551 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NeflP08551 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NeflP08551 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NeflP08551 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NeflP08551 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NeflP08551 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NeflP08551 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NeflP08551 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NeflP08551 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NeflP08551 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NeflP08551 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NeflP08551 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NeflP08551 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NeflP08551 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NeflP08551 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NeflP08551 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NeflP08551 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NeflP08551 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NeflP08551 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NeflP08551 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NeflP08551 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NeflP08551 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NeflP08551 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NeflP08551 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NeflP08551 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NeflP08551 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms