Protein–RNA interactions for Protein: P07141

Csf1, Macrophage colony-stimulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf1P07141 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csf1P07141 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csf1P07141 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csf1P07141 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Csf1P07141 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Csf1P07141 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Csf1P07141 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Csf1P07141 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Csf1P07141 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Csf1P07141 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csf1P07141 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csf1P07141 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csf1P07141 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Csf1P07141 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csf1P07141 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csf1P07141 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csf1P07141 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csf1P07141 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csf1P07141 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csf1P07141 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csf1P07141 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csf1P07141 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csf1P07141 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Csf1P07141 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms