Protein–RNA interactions for Protein: P05555

Itgam, Integrin alpha-M, mousemouse

Predictions only

Length 1,153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgamP05555 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ItgamP05555 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ItgamP05555 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ItgamP05555 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ItgamP05555 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ItgamP05555 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ItgamP05555 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ItgamP05555 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ItgamP05555 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ItgamP05555 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ItgamP05555 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ItgamP05555 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ItgamP05555 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ItgamP05555 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ItgamP05555 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ItgamP05555 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ItgamP05555 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ItgamP05555 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ItgamP05555 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ItgamP05555 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ItgamP05555 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ItgamP05555 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ItgamP05555 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ItgamP05555 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ItgamP05555 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ItgamP05555 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ItgamP05555 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ItgamP05555 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ItgamP05555 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ItgamP05555 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ItgamP05555 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ItgamP05555 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ItgamP05555 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ItgamP05555 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ItgamP05555 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ItgamP05555 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ItgamP05555 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ItgamP05555 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ItgamP05555 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ItgamP05555 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ItgamP05555 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ItgamP05555 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ItgamP05555 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ItgamP05555 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ItgamP05555 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ItgamP05555 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ItgamP05555 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ItgamP05555 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ItgamP05555 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ItgamP05555 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ItgamP05555 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ItgamP05555 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ItgamP05555 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ItgamP05555 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgamP05555 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgamP05555 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgamP05555 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgamP05555 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgamP05555 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgamP05555 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgamP05555 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgamP05555 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgamP05555 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgamP05555 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgamP05555 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgamP05555 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgamP05555 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgamP05555 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgamP05555 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgamP05555 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgamP05555 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgamP05555 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ItgamP05555 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ItgamP05555 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ItgamP05555 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ItgamP05555 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ItgamP05555 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ItgamP05555 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ItgamP05555 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ItgamP05555 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ItgamP05555 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ItgamP05555 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ItgamP05555 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ItgamP05555 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ItgamP05555 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ItgamP05555 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ItgamP05555 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ItgamP05555 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ItgamP05555 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ItgamP05555 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ItgamP05555 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ItgamP05555 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ItgamP05555 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ItgamP05555 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ItgamP05555 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ItgamP05555 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ItgamP05555 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ItgamP05555 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ItgamP05555 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ItgamP05555 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms