Protein–RNA interactions for Protein: P05366

Saa1, Serum amyloid A-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa1P05366 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Saa1P05366 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Saa1P05366 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Saa1P05366 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Saa1P05366 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Saa1P05366 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Saa1P05366 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Saa1P05366 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Saa1P05366 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Saa1P05366 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Saa1P05366 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa1P05366 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa1P05366 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa1P05366 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms