Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-Eb1P04230 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-Eb1P04230 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms