Protein–RNA interactions for Protein: P02831

Hoxa3, Homeobox protein Hox-A3, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa3P02831 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa3P02831 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms