Protein–RNA interactions for Protein: P01910

H2-Aa, H-2 class II histocompatibility antigen, A-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-AaP01910 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-AaP01910 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-AaP01910 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-AaP01910 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-AaP01910 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-AaP01910 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-AaP01910 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-AaP01910 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-AaP01910 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-AaP01910 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-AaP01910 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-AaP01910 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-AaP01910 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-AaP01910 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-AaP01910 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-AaP01910 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-AaP01910 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-AaP01910 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-AaP01910 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms